AFLP: principe

Bij de AFLP-techniek wordt het DNA met een restrictie-enzyme geknipt. Dat levert een mengsel van fragmenten op, dat in principe typerend is voor een bepaald organisme, maar is door de grote hoeveelheid fragmenten te complex om een bruikbare fingerprint te geven. Aan deze fragmenten ligeert men nu een adapter-DNA-fragment met een gekende sequentie. Vervolgens amplificeert men het mengsel met behulp van een primer die de adaptormolecule herkent, maar enkele nucleotiden langer is (bv verlengd met TAG). Hierdoor zullen enkel die fragmenten die na de adaptor starten met een complementaire sequentie (in het voorbeeld dus ATC), worden geamplificeerd. Door deze bijkomende selectie wordt het mengsel sterk vereenvoudigd en kan men na gelelektroforese tot een interpreteerbaar patroon komen. Bovendien kan men door een andere keuze van de nucleotiden waarmee de primer wordt verlengd, op een eenvoudige manier van hetzelfde digest toch verschillende patronen verkrijgen.

Bron:Handboek procestechnieken en -engineering,  2000.